发放《排放许可证》的原则是排污单位未超出总量控制指标，对超出排污总量控制指标的排污单位，只能颁发《临时排放许可证》，并限期消减排放量。《排放许可证》的有效期限不超过5年，《临时排放许可证》的有效期限最长不超过2年。《排放许可证》有效期满前3个月，必须重新申请换证。对超量排污的，中止或吊销《排放许可证》。申报的具体程序为：
一、新建、改建、扩建项目在污染防治设施竣工并验收合格后一个月内申请办理，填报《排污申报登记表》，经行业主管部门审核报环保局登记注册，领取《排污申报登记注册证》。
二、环保局根据排污总量控制指标确定发放《排放许可证》或《临时排放许可证》。
三、排放污染物若发生重大变更，应在变更前十五天内申办变更手续，紧急重大变更的，须在三天内申办并填写《排污变更申报登记表》。停止经营的，一周内申办注销登记，并交回《排污申报登记注册证》。
四、持有《排放许可证》或《临时排放许可证》的排污单位，不免除缴纳排污费和其它法律规定的责任。
